MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 37127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_000854	ACCC	2	8	213020	213027	25 %	0 %	0 %	75 %	14600606
4503	NC_000854	GGT	2	6	213145	213150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600606
4504	NC_000854	AGC	2	6	213219	213224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600606
4505	NC_000854	CTA	2	6	213255	213260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600606
4506	NC_000854	AAG	2	6	213281	213286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600606
4507	NC_000854	TCCA	2	8	213293	213300	25 %	25 %	0 %	50 %	14600606
4508	NC_000854	GCT	2	6	213336	213341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_000854	AGA	2	6	213365	213370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_000854	TTAA	2	8	213382	213389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_000854	CAG	2	6	213424	213429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_000854	TTAGT	2	10	213457	213466	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_000854	TGG	2	6	213597	213602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430981
4514	NC_000854	CTTA	2	8	213639	213646	25 %	50 %	0 %	25 %	118430981
4515	NC_000854	GGC	2	6	213659	213664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430981
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4517	NC_000854	GAG	2	6	213695	213700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430981
4518	NC_000854	AGT	2	6	213793	213798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430981
4519	NC_000854	GTT	2	6	213806	213811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430981
4520	NC_000854	GAT	2	6	213851	213856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430981
4521	NC_000854	TAA	2	6	213990	213995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430981
4522	NC_000854	ACC	2	6	214009	214014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430981
4523	NC_000854	ATCG	2	8	214017	214024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_000854	GCC	2	6	214161	214166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600608
4525	NC_000854	TCTT	2	8	214180	214187	0 %	75 %	0 %	25 %	14600608
4526	NC_000854	CTC	2	6	214218	214223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600608
4527	NC_000854	GTA	2	6	214227	214232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600608
4528	NC_000854	C	6	6	214298	214303	0 %	0 %	0 %	100 %	14600608
4529	NC_000854	TAGC	2	8	214319	214326	25 %	25 %	25 %	25 %	14600608
4530	NC_000854	CAA	2	6	214502	214507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600608
4531	NC_000854	C	7	7	214580	214586	0 %	0 %	0 %	100 %	14600608
4532	NC_000854	TGAG	2	8	214604	214611	25 %	25 %	50 %	0 %	14600608
4533	NC_000854	GGA	2	6	214647	214652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600608
4534	NC_000854	ACG	2	6	214827	214832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600608
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4537	NC_000854	TC	3	6	214865	214870	0 %	50 %	0 %	50 %	118430982
4538	NC_000854	TA	3	6	214946	214951	50 %	50 %	0 %	0 %	118430982
4539	NC_000854	TCC	2	6	215005	215010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430982
4540	NC_000854	CCTGAG	2	12	215057	215068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118430982
4541	NC_000854	GGC	2	6	215108	215113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430982
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4544	NC_000854	CCT	2	6	215166	215171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600610
4545	NC_000854	TC	3	6	215178	215183	0 %	50 %	0 %	50 %	14600610
4546	NC_000854	CTA	2	6	215189	215194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600610
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4549	NC_000854	GCCATC	2	12	215428	215439	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14600610
4550	NC_000854	GCC	2	6	215443	215448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600610
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4552	NC_000854	TCC	2	6	215489	215494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600610
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4554	NC_000854	CTC	2	6	215544	215549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600610
4555	NC_000854	CCG	2	6	215560	215565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_000854	TC	3	6	215622	215627	0 %	50 %	0 %	50 %	118430983
4557	NC_000854	CT	3	6	215656	215661	0 %	50 %	0 %	50 %	118430983
4558	NC_000854	CATCCT	2	12	215689	215700	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	118430983
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4565	NC_000854	CCT	2	6	215955	215960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430983
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4567	NC_000854	CCTC	2	8	215997	216004	0 %	25 %	0 %	75 %	118430983
4568	NC_000854	TCG	2	6	216054	216059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4570	NC_000854	AT	3	6	216241	216246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_000854	TG	3	6	216419	216424	0 %	50 %	50 %	0 %	118430984
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4580	NC_000854	TGA	2	6	216842	216847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430984
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4584	NC_000854	TCG	2	6	216964	216969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430984
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4586	NC_000854	CTCTT	2	10	217111	217120	0 %	60 %	0 %	40 %	118430984
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4592	NC_000854	TAT	2	6	217433	217438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430984
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4594	NC_000854	AAAG	2	8	217506	217513	75 %	0 %	25 %	0 %	118430984
4595	NC_000854	T	6	6	217550	217555	0 %	100 %	0 %	0 %	118430984
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4598	NC_000854	ACCTC	2	10	217619	217628	20 %	20 %	0 %	60 %	118430985
4599	NC_000854	CT	4	8	217663	217670	0 %	50 %	0 %	50 %	118430985
4600	NC_000854	AC	3	6	217694	217699	50 %	0 %	0 %	50 %	118430985
4601	NC_000854	GGA	2	6	217740	217745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430985
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4607	NC_000854	TTA	2	6	218074	218079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430985
4608	NC_000854	CAT	2	6	218162	218167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430985
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4612	NC_000854	ATC	2	6	218289	218294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430985
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4619	NC_000854	CCA	2	6	218989	218994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430986
4620	NC_000854	CTC	2	6	219029	219034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430986
4621	NC_000854	CAT	2	6	219037	219042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430986
4622	NC_000854	TAT	2	6	219118	219123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430986
4623	NC_000854	TCC	2	6	219124	219129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430986
4624	NC_000854	TGC	2	6	219144	219149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430986
4625	NC_000854	CTA	2	6	219150	219155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430986
4626	NC_000854	CAA	3	9	219180	219188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430986
4627	NC_000854	ATA	2	6	219232	219237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430986
4628	NC_000854	TA	3	6	219236	219241	50 %	50 %	0 %	0 %	118430986
4629	NC_000854	CTG	2	6	219284	219289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430986
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4633	NC_000854	TGC	2	6	219629	219634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600616
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4640	NC_000854	ATCA	2	8	220148	220155	50 %	25 %	0 %	25 %	14600616
4641	NC_000854	GCC	3	9	220170	220178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600616
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4652	NC_000854	TA	3	6	220703	220708	50 %	50 %	0 %	0 %	118430987
4653	NC_000854	CTC	2	6	220710	220715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430987
4654	NC_000854	GCT	2	6	220741	220746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430987
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4657	NC_000854	TCT	2	6	220901	220906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430987
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4667	NC_000854	TATT	2	8	221678	221685	25 %	75 %	0 %	0 %	118430987
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4683	NC_000854	CATA	2	8	222649	222656	50 %	25 %	0 %	25 %	118430987
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4752	NC_000854	CGT	3	9	225411	225419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430989
4753	NC_000854	CGG	2	6	225422	225427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430989
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4866	NC_000854	GCCT	2	8	230294	230301	0 %	25 %	25 %	50 %	118430993
4867	NC_000854	GA	3	6	230307	230312	50 %	0 %	50 %	0 %	118430993
4868	NC_000854	CAC	2	6	230337	230342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430993
4869	NC_000854	CGTCA	2	10	230361	230370	20 %	20 %	20 %	40 %	118430993
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4871	NC_000854	TCC	2	6	230413	230418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4995	NC_000854	CCT	2	6	235584	235589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
4996	NC_000854	CCT	2	6	235592	235597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
4997	NC_000854	TCC	2	6	235619	235624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
4998	NC_000854	CCG	2	6	235651	235656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430997
4999	NC_000854	AG	3	6	235680	235685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_000854	TCA	2	6	235733	235738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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